MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2015463471 · doi:10.1097/qai.0000000000000105

c-Src and Pyk2 Protein Tyrosine Kinases Play Protective Roles in Early HIV-1 Infection of CD4+ T-Cell Lines

2014· article· en· W2015463471 sur OpenAlexaff
Stephen D.S. McCarthy, Daniel Jung, Darinka Sakac, Donald R. Branch

Notice bibliographique

RevueJAIDS Journal of Acquired Immune Deficiency Syndromes · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensUniversité LavalUniversity of TorontoCanadian Blood Services
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésProto-oncogene tyrosine-protein kinase SrcTyrosine kinaseHuman immunodeficiency virus (HIV)KinaseProtein tyrosine phosphataseVirologyBiologyImmunologyCell biologyMedicineSignal transduction

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: During early HIV-1 infection of CD4 T-lymphocytes, many host protein tyrosine kinases become activated within minutes, including phosphoprotein pp60 (c-Src) and the focal adhesion kinase family member, proline-rich tyrosine kinase 2 (Pyk2). Whether their activation facilitates or impedes infection remains to be determined. METHODS: c-Src kinase inhibitors (SU6656, PP1, and PP2), adenovectors [wild-type and dominant-negative (DN) c-src] or siRNA (targeting c-src or pyk2) were used to inhibit, compete with or knockdown c-Src in Jurkat C, Jurkat E6-1, Hut 78 or Kit225 T-cell lines. Cells were then infected with HIV-1 luciferase reporter virus expressing VSV-G or HXB2(X4) envelope, and luciferase activity was measured after 2 days. Reverse transcriptase activity and viral cDNA were measured 1 hour after infection, whereas integrated virus was measured 12 hours after infection. RESULTS: Pretreating Jurkat T-cells with SU6656 led to increased VSV-G luciferase activity. In the adenovector experiments, T-cells overexpressing dominant-negative c-Src, but not wild-type c-Src, showed increased luciferase activity after VSV-G infection. siRNA knockdown of c-Src or Pyk2, followed by HXB2 infection in Jurkat T-cells, lead to increased reverse transcriptase activity, viral cDNA, integrated virus, and increased luciferase activity. CONCLUSIONS: Pyk2 is known to interact with c-Src. Thus, Pyk2 activation that coincides with increased c-Src activity during HIV-1 infection could be responsible for c-Src activation. Reduced c-Src activation increases HIV-1 reverse transcription, integration, and/or transcription, suggesting the high c-Src activity seen early in HIV-1 infection may be a cellular response to slow or prevent early infection in CD4 T-cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJAIDS Journal of Acquired Immune Deficiency SyndromesMême sujetHIV Research and TreatmentTravaux en français237 207