Use of an Innovative Web-Based Laboratory Surveillance Platform to Analyze Mixed Infections Between Human Metapneumovirus (hMPV) and Other Respiratory Viruses Circulating in Alberta (AB), Canada (2009–2012)
Notice bibliographique
Résumé
We investigated the proportions of mono vs. mixed infections for human metapneumovirus (hMPV) as compared to adenovirus (ADV), four types of coronavirus (CRV), parainfluenza virus (PIV), RSV, and enterovirus/rhinovirus (ERV) in Alberta, Canada. Using the Data Integration for Alberta Laboratories (DIAL) platform, 26,226 respiratory specimens at ProvLab between 1 July 2009 and 30 June 2012 were selected and included in the study. Using the Respiratory Virus Panel these specimens tested positive for one or more respiratory virus and negative for influenza A and B. From our subset hMPV was the fourth most common virus (n=2,561) with 373 (15%) identified as mixed infection using DIAL. Mixed infection with hMPV was most commonly found in infants less than 6 months old and ERV was most commonly found in mixed infection with hMPV (230/373, 56%) across all age groups. The proportion of mixed-infection vs. mono-infection was highest for ADV (46%), followed by CRV 229E (32%), CRV HKU1 (31%), CRV NL63 (28%), CRV OC43 (23%), PIV (20%), RSV (17%), hMPV (15%) and ERV (13%). hMPV was significantly more likely to be identified in mono infection as compared with ADV, CRV, PIV, and RSV with the exception of ERV [p < 0.05].
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».