Theory and applications of geometric scaling of localized calcium release events
Notice bibliographique
Résumé
Geometric measures of localized calcium release (LCR) events have been used to understand their biophysical basis. We found power law scaling between three such metrics-maximum amplitude (MA), mass above half-maximum amplitude (MHM), and area at half-maximum amplitude (AHM). In an effort to understand this scaling a minimal analytic model was employed to simulate LCR events recorded by confocal line scan. The distribution of logMHM as a function of logAHM, pMHM(pAHM), was dependent on model parameters such as channel open time, current size, line scan offset, and apparent diffusion coefficient. The distribution of log[MHM/AHM] as a function of logMA, p[MHM/AHM](pMA), was invariant, reflecting the gross geometry of the LCR event. The findings of the model were applied to real LCR line scan data from rabbit portal vein myocytes, rat cerebral artery myocytes, and guinea pig fundus knurled cells. pMHM(pAHM) could be used to distinguish two populations of LCR events in portal vein, even at the scale of "calcium noise," and to calculate the relative current of the two. The relative current was 2. pMHM(pAHM) could also be used to study pharmacological effects. The pMHM(pAHM) distribution of knurled cell LCR events was markedly contracted by ryanodine, suggesting a reduction in channel open time. The p[MHM/AHM](pMA) distributions were invariant across all cell types and were consistent with the model, underlying the common physical basis of their geometry. The geometric scaling of LCR events demonstrated here may help with their mechanistic characterization.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,011 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,002 |
| Communication savante | 0,002 | 0,003 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».