A Variant in the Cytochrome P450 Oxidoreductase Gene Is Associated with Breast Cancer Risk in African Americans
Notice bibliographique
Résumé
Variation in the cytochrome P450 oxidoreductase (POR) gene, a key regulator of type II cytochrome P450 enzymes, may affect exposure to endogenous steroid hormones and breast cancer risk. We sequenced the POR locus and tested candidate polymorphisms G5G and A503V for association with breast cancer risk among women in the Multiethnic Cohort Study (1,615 cases and 1,962 controls). The single nucleotide polymorphism (SNP) A503V was common in all racial/ethnic populations (minor allele frequency, > or =0.05) but was not associated with risk. SNP G5G (A --> G nucleotide change), which lies in a suggestive exonic splicing enhancer motif in exon 1, was common only in African Americans (minor allele frequency, 0.21) and the homozygous state was modestly associated with increased breast risk among all cases [345 cases and 426 controls; odds ratio (OR), 1.64; 95% confidence interval (CI), 0.89-3.04; P = 0.12] and among cases with advanced disease (95 cases: OR, 3.08; 95% CI, 1.42-6.70; P = 0.005). In an attempt to replicate this association, we genotyped SNP G5G in additional African American case-control studies (747 cases and 468 controls). Nonsignificant positive associations were noted with the GG genotype class in all studies. In the pooled analysis (1,038 cases and 877 controls with genotype data), the association was statistically significant among all cases (OR, 1.58; 95% CI, 1.04-2.41; P = 0.03) and stronger in those with advanced disease (411 cases and 877 controls; OR, 2.60; 95% CI, 1.56-4.34; P = 0.0002). These data suggest that African Americans harbor an allele at the POR locus that may increase breast cancer risk.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».