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Enregistrement W2015685899 · doi:10.1111/j.1529-8817.2004.04029.x

A PHYLOGENETIC STUDY OF PARASITIC GENERA PLACED IN THE FAMILY CHOREOCOLACACEAE (RHODOPHYTA)<sup>1</sup>

2004· article· en· W2015685899 sur OpenAlexaff
Giuseppe C. Zuccarello, Debra A. Moon, Lynda J. Goff

Notice bibliographique

RevueJournal of Phycology · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueMarine and coastal plant biology
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyRhodomelaceaeTribePhylogenetic treeHost (biology)Obligate parasiteGenusPhylogeneticsZoologyTaxonomy (biology)EcologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Red algal parasites are common and have a unique type of development in which parasite nuclei are transferred to host cells and “control” host cell development. Previous phylogenetic studies have concentrated on parasites closely related to their hosts, termed adelphoparasites. A second set of parasites, usually classified in a different family or tribe from their host, termed alloparasites, have not been studied phylogenetically. This study concentrates on the wholly parasitic family, the Choreocolacaceae (Gigartinales). Using small subunit rDNA sequence data, we found that all the parasites studied are within the same family as their host. Our data support the placement of Holmsella , species of which parasitize Gracilaria and Gracilariopsis , in the order Gracilariales and suggest that Holmsella is an old parasitic genus. Most other species of the Choreocolacaceae parasitize species of the Rhodomelaceae. The one exception is the hyperparasitism between Harveyella mirabilis (Reinsch) F. Schmitz et Reinke (Rhodomelaceae) and the parasite Gonimophyllum skottsbergii Setchell (Delesseriaceae). The parasites Bostrychiocolax australis Zuccarello et West and Dawsoniocolax bostrychiae (Joly et Yamaguishi‐Tomita) Joly et Yamaguishi‐Tomita are placed within the tribe Bostrychiae as are their hosts. Harveyella mirabilis has a single origin and has switched hosts several times during its passage between the Atlantic and Pacific Oceans. Evidence does not support the continued recognition of the family Choreocolacaceae. Our results also indicate that the distinction between adelphoparasites and alloparasites is unwarranted, with a continuum between newly evolved parasites closely related to their hosts and parasites less closely related to their hosts.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,202
Score d'incertitude au seuil0,419

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations36
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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