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Enregistrement W2015726474 · doi:10.1002/jobm.200510006

Isolation and characterization of a biphenyl-utilizing psychrotrophic bacterium,Hydrogenophaga taeniospiralis IA3-A, that cometabolize dichlorobiphenyls and polychlorinated biphenyl congeners in Aroclor 1221

2006· article· en· W2015726474 sur OpenAlexaff
Adewale J. Lambo, Thakor R. Patel

Notice bibliographique

RevueJournal of Basic Microbiology · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial bioremediation and biosurfactants
Établissements canadiensMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiphenylChemistryCometabolismBacteriaChlorinePolychlorinated biphenylEnvironmental chemistryFood scienceOrganic chemistryBioremediationBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A psychrotrophic bacterium isolated from polychlorinated biphenyls (PCBs)-contaminated soil grew on biphenyl as sole carbon and energy source, and actively cometabolized PCBs at low temperature. Analysis of cellular fatty acids indicate that the bacterium is most closely related to Hydrogenophaga taeniospiralis. Resting cells incubated with 10 ppm of Aroclor 1221 at 5 or 30 degrees C for 48 h removed all mono-, most di-, and several trichlorobiphenyls. At 5 degrees C, removal of MCBs (monochlorobiphenyls) was between 63 to 89%, DCBs (dichlorobiphenyls) was between 30 to 78%, and TCBs (trichlorobiphenyls) was between 30 to 75%. At 30 degrees C, removal of MCBs was 100%, DCBs was between 30 to 100%, and TCBs was between 27 to 59%. Congeners with two or more ortho chlorine were generally resistant to degradation. However, removal of di-ortho plus para-substituted congeners at 30 degrees C and not at 5 degrees C, suggest that the presence of a para-chlorine enhanced the cometabolism of these congeners at 30 degrees C. Furthermore, after 72 h, resting cells removed 68 and 83% of 500 microM of 2,4'-dichlorobiphenyl (2,4'-DCB) and, 35 and 44% of 500 microM of 2,3-dichlorobiphenyl (2,3-DCB) at 5 and 30 degrees C, respectively. Analysis of metabolites by GC-MS indicates that the cometabolized 2,3-DCB was completely recovered as 2,3-chlorobenzoic acid (2,3-CBA), while the cometabolized 2,4'-DCB was not completely recovered as chlorobenzoic acid. To our knowledge, it is the first strain of Hydrogenophaga taeniospiralis found to degrade an organic pollutant, and also the first psychrotrophic strain of a member of the genus Hydrogenophaga to grow on biphenyl or cometabolize PCBs at low temperature. Results suggest that the bacterium has potential use in the bioremediation of PCB-contaminated sites in cold regions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,200
Écart entre enseignants0,191 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations49
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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