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Enregistrement W2015771340 · doi:10.1002/em.1080

Nitric oxide donors induce large‐scale deletion mutations in human lymphoblastoid cells: Implications for mutations in T‐lymphocytes from arthritis patients

2001· article· en· W2015771340 sur OpenAlexaff
Donna D. Grant, Rose Goldstein, Jacob Karsh, H.C. Birnboim

Notice bibliographique

RevueEnvironmental and Molecular Mutagenesis · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBiochemical and Molecular Research
Établissements canadiensOttawa HospitalOttawa Regional Cancer FoundationUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferaseMolecular biologyMutantLymphoblastBiologyExonMutationArthritisGeneticsCell cultureImmunologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Rheumatoid arthritis (RA) is an inflammatory disease in which high levels of reactive nitrogen oxygen species (RNOS) may be present in the affected joints. RNOS are known to produce small-scale mutational events (transitions, transversions, small insertions, and small deletions) but the ability of these compounds to cause deletion of large segments of genomic DNA has not been previously determined. To address this question, a human lymphoblastoid cell line (WIL2-NS) was exposed to nitric oxide (NO)-donating drugs and hypoxanthine phosphoribosyltransferase (hprt)-negative clones were selected and analyzed by multiplex-PCR. Large-scale deletions accounted for 60-80% of hprt mutations arising in drug-treated cultures compared to 12% in untreated cultures (P-values of 0.006 and 0.0001, respectively, in two experiments). Deletion mutations in untreated cultures affected exon 9, whereas 75% of drug-induced deletion mutations affected exons 2, 3, and 9, and the remainder were very large, ranging from 26 to 1200 kbp. To compare this spectrum of NO-induced mutations in a lymphoblastoid line to that arising in vivo in arthritis patients, T-cells from RA patients, osteoarthritis (OA) patients, and controls were cloned and similarly analyzed. We previously showed that the overall frequency of Hprt mutant clones from patients is appreciably elevated compared to that of control subjects. Large-scale hprt deletions (0.5 to >26 kb) were detected in mutant T-cell clones from both RA and OA patients and also from control subjects. A total of 54 mutant clones from 16 RA patients and 19 mutant clones from 6 OA patients were studied. Of these, 6 clones (from 3 RA and 1 OA patient) had suffered large-scale deletions. A total of 9 control subjects were studied and 62 mutant clones were obtained. Of these, 19 had suffered large-scale deletions, arising in 7 of 9 control subjects. In conclusion, (1) RNOS are capable of inducing large-scale deletion mutations in a human lymphoblastoid cell line and (2) large-scale deletion mutations were found in 10-30% of T-cell clones from RA and OA patients and controls, which we hypothesize may be induced by RNOS.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,206
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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