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Enregistrement W2015783821 · doi:10.5740/jaoacint.sgemccarron

Liquid Chromatography/Mass Spectrometry of Domoic Acid and Lipophilic Shellfish Toxins with Selected Reaction Monitoring and Optional Confirmation by Library Searching of Product Ion Spectra

2014· article· en· W2015783821 sur OpenAlexafffundabout
Pearse McCarron, Elliott J. Wright, Michael A. Quilliam

Notice bibliographique

RevueJournal of AOAC International · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMarine Toxins and Detection Methods
Établissements canadiensNational Research Council Canada
Organismes subventionnairesCanadian Food Inspection Agency
Mots-clésDomoic acidChromatographyMass spectrometryMytilusTriple quadrupole mass spectrometerMarine toxinMusselDiarrhetic shellfish poisoningSelected reaction monitoringShellfishShellfish poisoningChemistryQuadrupole ion trapOkadaic acidQuadrupole time of flightIon trapBiologyElectrospray ionizationTandem mass spectrometryFisheryToxinBiochemistryFish <Actinopterygii>

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

LC/MS methodology for the analysis of domoic acid and lipophilic toxins in shellfish was developed using a hybrid triple quadrupole linear ion trap mass spectrometer. For routine quantitation a scheduled selected reaction monitoring (SRM) method for the analysis of domoic acid, okadaic acid, dinophysistoxins, azaspiracids, pectenotoxins, yessotoxins, gymnodimines, spirolides, and pinnatoxins was developed and validated. The method performed well in terms of LOD, linearity, precision, and trueness. Taking advantage of the high instrument sensitivity, matrix effects were mitigated by reducing the amount of sample introduced to the mass spectrometer. Optionally, samples can be analyzed using information dependent acquisition (IDA) methods, either in positive or negative mode, which can provide an extra level of confirmation by matching the full product ion spectra acquired for a sample with those from a specially constructed spectral library. Methods were applied to the analysis df a new certified reference material and Canadian mussels (Mytilus edulis) implicated in a 2011 diarrhetic shellfish poisoning (DSP) incident. The scheduled SRM method enabled the screening and quantitation of multiple phycotoxins. As DSP had not previously been observed in this area of Canada, positive identification of putative toxins was accomplished using the IDA and spectral search method. Analysis of the 2011 toxic mussel samples revealed the presence of high levels of dinophysistoxin-1, which explained the DSP symptoms, as well as pectenotoxins, yessotoxins, and variety of cyclic imines.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,231
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations47
Publié2014
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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