The zebrafish mutant gene chardonnay (cdy) encodes divalent metal transporter 1 (DMT1)
Notice bibliographique
Résumé
Iron is an essential nutrient required for the function of all cells, most notably for the production of hemoglobin in red blood cells. Defects in the mechanisms of iron absorption, storage, or utilization can lead to disorders of iron-limited erythropoiesis or iron overload. In an effort to further understand these processes, we have used the zebrafish as a genetic system to study vertebrate iron metabolism. Here we characterized the phenotype of chardonnay (cdy), a zebrafish mutant with hypochromic, microcytic anemia, and positioned the mutant gene on linkage group 11. The cdy gene was isolated by a functional genomics approach in which we used a combination of expression studies, sequence analyses, and radiation hybrid panel mapping. We identified erythroid-specific genes using a whole embryo mRNA in situ hybridization screen and placed these genes on the zebrafish genomic map. One of these genes encoded the iron transporter divalent metal transporter 1 (DMT1) and colocalized with the cdy gene. We identified a nonsense mutation in the cdy allele and demonstrated that, whereas wild-type zebrafish DMT1 protein can transport iron, the truncated protein expressed in cdy mutants is not functional. Our studies further demonstrate the conservation of iron metabolism in vertebrates and suggest the existence of an alternative pathway of intestinal and red blood cell iron uptake.
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».