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Enregistrement W2015869692 · doi:10.1111/j.1440-1681.2009.05278.x

Dissecting the mechanism of Ca<sup>2+</sup>‐triggered membrane fusion: Probing protein function using thiol reactivity

2009· article· en· W2015869692 sur OpenAlexafffund
Kendra L. Furber, Kwin T Dean, Jens R. Coorssen

Notice bibliographique

RevueClinical and Experimental Pharmacology and Physiology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLipid Membrane Structure and Behavior
Établissements canadiensHotchkiss Brain InstituteUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésLipid bilayer fusionFusion proteinChemistryThiolMembrane curvatureFusionBiochemistryMembrane proteinBiophysicsFunction (biology)MembraneCell biologyVesicleBiologyRecombinant DNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

1. Ca(2+)-triggered membrane fusion involves the coordinated actions of both lipids and proteins, but the specific mechanisms remain poorly understood. The urchin cortical vesicle model is a stage-specific native preparation fully enabling the directly coupled functional-molecular analyses necessary to identify critical components of fast triggered membrane fusion. 2. Recent work on lipidic components has established a direct role for cholesterol in the fusion mechanism via local contribution of negative curvature to readily enable the formation of transient lipidic fusion intermediates. In addition, cholesterol- and sphingomyelin-enriched domains regulate the efficiency of fusion by focally organizing other components to ensure an optimized response to the triggering Ca(2+) transient. 3. There is less known about the identity of proteins involved in the Ca(2+)-triggering steps of membrane fusion. Thiol reagents can be used as unbiased tools to probe protein functions. Comparisons of several thiol-reactive reagents have identified different effects on Ca(2+) sensitivity and the extent of fusion, suggesting that there are at least two distinct thiol sites that participate in the fusion mechanism: one that regulates the efficiency of Ca(2+) sensing/triggering and one that may function during the membrane merger event itself. 4. To identify the proteins that regulate Ca(2+) sensitivity, the fluorescent thiol reagent Lucifer yellow iodoacetamide was used to potentiate fusion and simultaneously tag the proteins involved. Ongoing work involves the isolation of cholesterol-enriched membrane fractions to reduce the complexity of the labelled proteome, narrowing the number of candidate proteins.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,504

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,342
Écart entre enseignants0,316 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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