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Enregistrement W2015953599 · doi:10.1371/journal.ppat.1000741

Nucleoporin 153 Arrests the Nuclear Import of Hepatitis B Virus Capsids in the Nuclear Basket

2010· article· en· W2015953599 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevuePLoS Pathogens · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueNuclear Structure and Function
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchDeutsche ForschungsgemeinschaftMichael Smith Health Research BC
Mots-clésNuclear transportCapsidNuclear poreNucleoporinGenomeImportinBiologyVirologyCell nucleusCell biologyCytoplasmGeneticsVirusGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Virtually all DNA viruses including hepatitis B viruses (HBV) replicate their genome inside the nucleus. In non-dividing cells, the genome has to pass through the nuclear pore complexes (NPCs) by the aid of nuclear transport receptors as e.g. importin beta (karyopherin). Most viruses release their genome in the cytoplasm or at the cytosolic face of the NPC, as the diameter of their capsids exceeds the size of the NPC. The DNA genome of HBV is derived from reverse transcription of an RNA pregenome. Genome maturation occurs in cytosolic capsids and progeny capsids can deliver the genome into the nucleus causing nuclear genome amplification. The karyophilic capsids are small enough to pass the NPC, but nuclear entry of capsids with an immature genome is halted in the nuclear basket on the nuclear side of the NPC, and the genome remains encapsidated. In contrast, capsids with a mature genome enter the basket and consequently liberate the genome. Investigating the difference between immature and mature capsids, we found that mature capsids had to disintegrate in order to leave the nuclear basket. The arrest of a karyophilic cargo at the nuclear pore is a rare phenomenon, which has been described for only very few cellular proteins participating in nuclear entry. We analyzed the interactions causing HBV capsid retention. By pull-down assays and partial siRNA depletion, we showed that HBV capsids directly interact with nucleoporin 153 (Nup153), an essential protein of the nuclear basket which participates in nuclear transport via importin beta. The binding sites of importin beta and capsids were shown to overlap but capsid binding was 150-fold stronger. In cellulo experiments using digitonin-permeabilized cells confirmed the interference between capsid binding and nuclear import by importin beta. Collectively, our findings describe a unique nuclear import strategy not only for viruses but for all karyophilic cargos.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,898
Score d'incertitude au seuil0,414

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,203
Écart entre enseignants0,197 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle