Molecular identity of a pan cancer marker, CA215
Notice bibliographique
Résumé
The molecular nature of cancer-associated antigen, CA215 which reacts with RP215 monoclonal antibody and its unique epitope(s)was characterized. RP215 was initially selected and produced from one of 3,000 hybridomas which were generated from mice immunized with the cell extract of OC-3-VGH ovarian cancer cells. This cancer-associated antigen from various sources including cancer cell extract, shed culture medium and affinity-purified forms was analyzed by MALDI-TOF MS (Matrix Adsorption Laser Desorption Ionization-Time of Flight Mass Spectrometry), Western blot, carbohydrate profiling as well as enzyme immunoassays. The results of this study showed that CA215 is homologous to the heavy chains of human immunoglobulins with molecular sizes ranging from 50 to 70 KDa, when probed with RP215 or anti-human immunoglobulin G, A or M. Treatments of cancer cells with NaIO(4) drastically reduce RP215 binding to the carbohydrate-associated epitope(s) of CA215 located on the variable domain of the human immunoglobulin heavy chains. Further studies indicated that CA215 is predominantly expressed by cancer cells in both secreted and membrane-bound monomeric forms. The carbohydrate-associated epitope(s) with pH-sensitive immunoactivity appear to be present only in cancer cell-derived immunoglobulins, but not in normal human immunoglobulins. Compared to normal immunoglobulin G, CA215 contains a significantly higher percentage of N-acetyl and N-glycoyl neuraminic acid (28% vs. 8%) in the O-linked glycans, but a lower content of N-acetylglucosamine (28% vs. 41%) in the N-linked ones. It was concluded from this study that RP215 reacts specifically with carbohydrate-associated epitope(s) of immunoglobulin heavy chains expressed by various human cancer cells.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».