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Enregistrement W2016045480 · doi:10.1139/b00-063

Open letter to the scientific community of mycologists

2000· letter· en· W2016045480 sur OpenAlexvenueno aff
Reinhard Agerer, Joe Ammirati, P. Blanz, Régis Courtecuisse, Dennis E. Desjardin, W. Gams, Nils Hallenberg, Roy E. Halling, David L. Hawksworth, Egon Horak, Richard P. Korf, Gregory M. Mueller, Franz Oberwinkler, Gerhard Rambold, Richard C. Summerbell, Dagmar Triebel, Roy Watling

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Botany · 2000
Typeletter
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Pathogens and Fungal Diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

To help minimise invalid publication of newly proposed scientific names of fungi, Korf (1995) provided advice on how to guarantee valid publication, and offered a few simple guidelines for authors, reviewers, and editors. He regretted that “unfortunately many of the errors are committed by highly respected mycologists, and published in thoroughly respectable journals” and emphasised that “although the ultimate responsibility for publishing correct names lies with authors, clearly reviewers and editors are shirking their duties to advise authors of such errors prior to publication.” To be published validly, names must be introduced according to requirements of the International Code of Botanical Nomenclature (Greuter et al. 1994, 2000). Since 1990, it has been compulsory to deposit the vouchers for new species and infraspecific taxa, the name-bearing types, in an herbarium or other collection. It is generally accepted that such voucher specimens should be deposited in publicly accessible reference collections such as herbaria. However, voucher collections are invariably necessary, not only when new fungi are described, but also in connection with any scientific study, whether by taxonomists, systematists, physiologists, chemists, molecular biologists, pathologists, ecologists, clinicians, etc., dealing with organisms. It is essential to preserve voucher specimens as dried material and, where possible, as permanently preserved living cultures. When none of the investigated material is preserved, it is impossible to confirm the identity of the investigated taxa. If species concepts change, it is particularly crucial to be able to re-identify the organism at a later time. There are several examples of entities once thought to be species but now revealed as species complexes, i.e., the species concept has been changed, including Pisolithus tinctorius (Burgess et al. 1995) and Paxillus involutus (Fries 1985; Hahn and Agerer 1999). In such cases, re-identification of the original material is necessary to know which organism was studied so that previous work will continue to be relevant. In recent years, molecular biological studies have had a tremendous impact on systematics, taxonomy, and ecology. DNA sequences are frequently obtained from fungal cultures. Too often there is no reference to either an exact citation of the

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,011
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,099
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Commentaire · Signal consensuel: Commentaire
Score de désaccord entre enseignants0,051
Score d'incertitude au seuil0,169

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0110,099
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0090,005
Communication savante0,0130,010
Science ouverte0,0030,009
Intégrité de la recherche0,0280,025
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0510,062

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreCommentaire

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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