MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2016059067 · doi:10.1210/en.2007-0578

Acetylation of Histone H3 and Adrenergic-Regulated Gene Transcription in Rat Pinealocytes

2007· article· en· W2016059067 sur OpenAlexafffund
Angela Ho, D. M. Price, W. G. Dukewich, Noam Steinberg, Terra Arnason, Constance L. Chik

Notice bibliographique

RevueEndocrinology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHistone Deacetylase Inhibitors Research
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésMolecular biologyTrichostatin AHistone H3Histone deacetylaseHistone deacetylase inhibitorBiologyChromatin immunoprecipitationHDAC1HistoneHistone deacetylase 5RepressorPromoterGene expressionChemistryGeneBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In this study we investigated the effect of histone acetylation on the transcription of adrenergic-induced genes in rat pinealocytes. We found that treatment of pinealocytes with trichostatin A (TSA), a histone deacetylase inhibitor, caused hyperacetylation of histone H3 (H3) Lys14 at nanomolar concentrations. Hyperacetylation of H3 was also observed after treatment with scriptaid, a structurally unrelated histone deacetylase inhibitor. The effects of TSA and scriptaid were inhibitory on the adrenergic induction of arylalkylamine-n-acetyltransferase (aa-nat) mRNA, protein, and enzyme activity, and on melatonin production. TSA at higher concentrations also inhibited the adrenergic induction of mapk phosphatase-1 (mkp-1) and inducible cAMP early repressor mRNAs. In contrast, the effect of TSA on the norepinephrine induction of the c-fos mRNA was stimulatory. Moreover, the effect of TSA on adrenergic-induced gene transcription was dependent on the time of its addition; its effect was only observed during the active phase of transcription. Chromatin immunoprecipitation with antibodies against acetylated Lys14 of H3 showed an increase in DNA recovery of the promoter regions of aa-nat, mkp-1, and c-fos after treatment with TSA. Together, our results demonstrate that histone acetylation differentially influences the transcription of adrenergic-induced genes, an enhancing effect for c-fos but inhibitory for aa-nat, mkp-1, and inducible cAMP early repressor. Moreover, both inhibitory and enhancing effects appear to be mediated through specific modification of promoter-bound histones during gene transcription.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,303
Écart entre enseignants0,292 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2007
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueEndocrinologyMême sujetHistone Deacetylase Inhibitors ResearchTravaux en français237 207