Qualitative and Quantitative Polymerase Chain Reaction Assays for an Alfalfa (<i>Medicago sativa</i>)-Specific Reference Gene To Use in Monitoring Transgenic Cultivars
Notice bibliographique
Résumé
Genetically modified (GM) alfalfa (Medicago sativa) was marketed for the first time in 2005. For countries with established thresholds for GM plants, methods to detect and quantify their adventitious presence are required. We selected acetyl CoA carboxylase as a reference gene for the detection and quantification of GM alfalfa. Two qualitative polymerase chain reaction (PCR) assays (Acc1 and Acc2) were designed to detect alfalfa. Both were specific to alfalfa, amplifying DNA from 12 separate cultivars and showing negative results for PCR of 15 nonalfalfa plants. The limits of detection for Acc1 and Acc2 were 0.2 and 0.01%, respectively. A quantitative real-time PCR assay was also designed, having high linearity (r > 0.99) over alfalfa standard concentrations ranging from 100 to 2.0 x 10(5) pg of alfalfa DNA per PCR. The real-time PCR assay was effective in quantifying alfalfa DNA from forage- and concentrate-based mixed diets containing different amounts of alfalfa meal.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».