MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2016150118 · doi:10.1080/09553000802078370

Expression of an adenovirus encoded reporter gene and its reactivation following UVC and oxidative damage in cultured fish cells

2008· article· en· W2016150118 sur OpenAlexaff
Andrew J. Rainbow, Natalie Zacal

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Radiation Biology · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueVirus-based gene therapy research
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesNational Cancer Institute
Mots-clésReporter geneBiologyOxidative phosphorylationGeneGene expressionFish <Actinopterygii>Molecular biologyOxidative damageCell cultureAdenoviridaeCell biologyVirologyOxidative stressGeneticsGenetic enhancementBiochemistryFishery

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: Recombinant human adenovirus, AdCA35lacZ, was used to examine expression of a reporter gene and its reactivation following UVC (200-280 nm) and oxidative damage in fish cells. MATERIALS AND METHODS: AdCA35lacZ is a recombinant nonreplicating human adenovirus, which expresses the beta-galactosidase (beta-gal) reporter gene. UVC light produces DNA damage repaired by nucleotide excision repair (NER). In contrast, methylene blue plus visible light (MB+VL) produces oxidative DNA damage, mainly 8-oxoguanine, that is repaired by base excision repair (BER). We examined expression of the reporter gene and host cell reactivation (HCR) of the UVC-treated and MB+VL-treated reporter gene in fish cells. RESULTS: AdCA35lacZ infection of Chinook salmon cells (CHSE-214), eel cells (PBLE) and four rainbow trout cell lines (RTG-2, RT-Gill, RTS-34st and RTS-pBk), but not zebrafish (ZEB) or carp (EPC) cells resulted in expression of beta-gal. HCR of UVC-treated AdCA35lacZ in fish cells varied from that obtained in NER-deficient xeroderma pigmentosum group A fibroblasts to greater than that for NER-proficient normal human fibroblasts. HCR of UVC-treated AdCA35lacZ correlated with beta-gal expression levels for untreated AdCA35lacZ. Exposure of cells to fluorescent light (400-700 nm) increased expression of the undamaged reporter gene in normal human fibroblasts and in all fish cells except PBLE and increased HCR of the UVC-damaged reporter gene in fish cells but not in human fibroblasts. HCR of the MB + VL-treated reporter gene was similar to that in human cells for PBLE, CHSE-214, RTG-2 and RTS-pBk, but was reduced in RT-Gill and RTS-34st cells. CONCLUSIONS: These results indicate the detection of functional photoreactivation (PR) of UVC-induced DNA damage in fish cells but not in normal human fibroblasts and a link between NER and transcription of the reporter gene in the fish cells in the absence of PR. We show also efficient BER of the reporter gene in several fish cell lines.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,316
Écart entre enseignants0,297 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueInternational Journal of Radiation BiologyMême sujetVirus-based gene therapy researchTravaux en français237 207