Differential expression of genes encoding the phenylpropanoid pathway upon infection of soybean seedlings by <i>Rhizoctonia solani</i>
Notice bibliographique
Résumé
The impact of Rhizoctonia solani on gene expression of 14 genes and gene homologs encoding key enzymes leading to isoflavone synthesis in the phenylprapanoid pathway was quantified in soybean (Glycine max) seedlings using quantitative reverse transcription polymerase chain reaction. This method allowed accurate quantitative evaluation of expression ratios of genes encoding phenylalanine ammonia-lyase (PAL), chalcone synthase (CHS), chalcone isomerase (CHI), chalcone reductase (CHR), and isoflavone synthase (IFS) in 1-, 2-, and 3-week-old soybean seedlings infected with R. solani and in seedlings that were not infected. Rhizoctonia solani inoculations affected expression ratios of 4 of 14 genes. Compared with control seedlings, a substantial upregulation of CHS 5, CHS 6, and IFS 2 transcript ratios by 34%, 208%, and 226% was observed, respectively. Ratios of the gene encoding CHR were markedly upregulated in infected seedlings at 1 and 2 weeks postinfection with a substantial downregulation 3 weeks after infection. Gene expression was relatively constant for most genes over time, whereas gene expression of a few changed. The findings of the study highlight the necessity of investigating the molecular response of a plant to a pathogen by studying not only an individual gene of the phenylpropanoid pathway but several genes and their gene homologs.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».