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Enregistrement W2016394656 · doi:10.1016/j.febslet.2004.08.019

Comparative analysis of phosphoprotein‐enriched myocyte proteomes reveals widespread alterations during differentiation

2004· article· en· W2016394656 sur OpenAlexaff
Lawrence G. Puente, Jean-François Carrière, John F. Kelly, Lynn A. Megeney

Notice bibliographique

RevueFEBS Letters · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMuscle Physiology and Disorders
Établissements canadiensUniversity of OttawaOntario GenomicsInstitute for Biological SciencesOttawa Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPhosphoproteinC2C12MyogenesisPhosphorylationMyocyteProteomeBiologyProtein phosphorylationProteomicsCell biologySkeletal muscleCytoskeletonGel electrophoresisMolecular biologyChemistryBiochemistryCellGeneProtein kinase AAnatomy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The differentiation of skeletal muscle has been associated with altered phosphorylation status of individual proteins. However, a global analysis of protein phosphorylation during myogenesis has yet to be undertaken. Here, we report the identification of over 130 putative phosphoproteins from murine C2C12 muscle cells. Cell extracts were fractionated on phosphoprotein enrichment columns and the resulting proteins were detected by two-dimensional gel electrophoresis and silver stain, and identified by liquid chromatography coupled to electrospray tandem mass spectrometry. The early differentiation of C2C12 myoblasts was found to be accompanied by changes in the phosphorylation or expression of numerous proteins including cytoskeletal, heat shock and signaling proteins, the pp32 family of nuclear phosphoproteins, several disease-associated gene products and other characterized and uncharacterized proteins.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,248
Score d'incertitude au seuil0,492

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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