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Enregistrement W2016410233 · doi:10.1074/jbc.m112.446161

Sarco(endo)plasmic Reticulum Calcium ATPase (SERCA) Inhibition by Sarcolipin Is Encoded in Its Luminal Tail

2013· article· en· W2016410233 sur OpenAlexafffund
Przemek A. Gorski, John Paul Glaves, Peter Vangheluwe, Howard S. Young

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiac electrophysiology and arrhythmias
Établissements canadiensNational Institute for NanotechnologyUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésSERCAReticulumEndoplasmic reticulumCalciumCalcium ATPaseChemistryATPaseCell biologyBiophysicsInternal medicineBiochemistryEndocrinologyBiologyEnzymeMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The sarco(endo)plasmic reticulum calcium ATPase (SERCA) is regulated in a tissue-dependent manner via interaction with the short integral membrane proteins phospholamban (PLN) and sarcolipin (SLN). Although defects in SERCA activity are known to cause heart failure, the regulatory mechanisms imposed by PLN and SLN could have clinical implications for both heart and skeletal muscle diseases. PLN and SLN have significant sequence homology in their transmembrane regions, suggesting a similar mode of binding to SERCA. However, unlike PLN, SLN has a conserved C-terminal luminal tail composed of five amino acids ((27)RSYQY), which may contribute to a distinct SERCA regulatory mechanism. We have functionally characterized alanine mutants of the C-terminal tail of SLN using co-reconstituted proteoliposomes of SERCA and SLN. We found that Arg(27) and Tyr(31) are essential for SLN function. We also tested the effect of a truncated variant of SLN (Arg(27)stop) and extended chimeras of PLN with the five luminal residues of SLN added to its C terminus. The Arg(27)stop form of SLN resulted in loss of function, whereas the PLN chimeras resulted in superinhibition with characteristics of both PLN and SLN. Based on our results, we propose that the C-terminal tail of SLN is a distinct, essential domain in the regulation of SERCA and that the functional properties of the SLN tail can be transferred to PLN.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations71
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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