Left Ventricular Hypertrophy in New Hemodialysis Patients without Symptomatic Cardiac Disease
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
<h3>Abstract</h3> <h3>Introduction</h3> Heritable changes in cytosine methylation can arise stochastically in plant genomes independently of DNA sequence alterations. These so-called ‘spontaneous epimutations’ appear to be a byproduct of imperfect DNA methylation maintenance during mitotic or meitotic cell divisions. Accurate estimates of the rate and spectrum of these stochastic events are necessary to be able to quantify how epimutational processes shape methylome diversity in the context of plant evolution, development and aging. <h3>Method</h3> Here we describe <i>AlphaBeta</i>, a computational method for estimating epimutation rates and spectra from pedigree-based high-throughput DNA methylation data. The approach requires that the topology of the pedigree is known, which is typically the case in the experimental construction of mutation accumulation lines (MA-lines) in sexually or clonally reproducing species. However, this method also works for inferring somatic epimutation rates in long-lived perennials, such as trees, using leaf methylomes and coring data as input. In this case, we treat the tree branching structure as an intra-organismal phylogeny of somatic lineages and leverage information about the epimutational history of each branch. <h3>Results</h3> To illustrate the method, we applied <i>AlphaBeta</i> to multi-generational data from selfing- and asexually-derived MA-lines in Arabidopsis and dandelion, as well as to intra-generational leaf methylome data of a single poplar tree. Our results show that the epimutation landscape in plants is deeply conserved across angiosperm species, and that heritable epimutations originate mainly during somatic development, rather than from DNA methylation reinforcement errors during sexual reproduction. Finally, we also provide the first evidence that DNA methylation data, in conjunction with statistical epimutation models, can be used as a molecular clock for age-dating trees. <h3>Conclusion</h3> <i>AlphaBeta</i> faciliates unprecedented quantitative insights into epimutational processes in a wide range of plant systems. Software implementing our method is available as a Bioconductor R package at http://bioconductor.org/packages/3.10/bioc/html/AlphaBeta.html
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle