Multi‐dimensional phenotyping: towards a new taxonomy for airway disease
Notice bibliographique
Résumé
All the real knowledge which we possess, depends on methods by which we distinguish the similar from the dissimilar. The greater the number of natural distinctions this method comprehends the clearer becomes our idea of things. The more numerous the objects which employ our attention the more difficult it becomes to form such a method and the more necessary. Classification is a fundamental part of medicine. Diseases are often categorized according to pre-20th century descriptions and concepts of disease based on symptoms, signs and functional abnormalities rather than on underlying pathogenesis. Where the aetiology of disease has been revealed (for example in the infectious diseases) a more precise classification has become possible, but in the chronic inflammatory diseases, and in the inflammatory airway diseases in particular, where pathogenesis has been stubbornly difficult to elucidate, we still use broad descriptive terms such as asthma and chronic obstructive pulmonary disease, which defy precise definition because they encompass a wide spectrum of presentations and physiological and cellular abnormalities. It is our contention that these broad-brush terms have outlived their usefulness and that we should be looking to create a new taxonomy of airway disease-a taxonomy that more closely reflects the spectrum of phenotypes that are encompassed within the term airway inflammatory diseases, and that gives full recognition to late 20th and 21st century insights into the disordered physiology and cell biology that characterizes these conditions in the expectation that these will map more closely to both aetiology and response to treatment. Development of this taxonomy will require a much more complete and sophisticated correlation of the many variables that make up a condition than has been usual to employ in an approach that encompasses multi-dimensional phenotyping and uses complex statistical tools such as cluster analysis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,018 | 0,022 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,003 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,003 | 0,003 |
| Bibliométrie | 0,016 | 0,009 |
| Études des sciences et des technologies | 0,003 | 0,016 |
| Communication savante | 0,012 | 0,024 |
| Science ouverte | 0,005 | 0,009 |
| Intégrité de la recherche | 0,005 | 0,014 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,003 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».