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Enregistrement W2016552348 · doi:10.1242/jeb.030866

Changes in thyroid hormone reception precede SWS1 opsin downregulation in trout retina

2009· article· en· W2016552348 sur OpenAlexaff
Jason C. Raine, Craig W. Hawryshyn

Notice bibliographique

RevueJournal of Experimental Biology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRetinal Development and Disorders
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEndocrinologyInternal medicineRetinaBiologyDownregulation and upregulationHormoneOpsinThyroidRetinalThyroid hormone receptorDeiodinaseTriiodothyronineMedicineGeneRhodopsinNeuroscienceGeneticsBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Rainbow trout undergo natural cone degeneration and thus are interesting models for examining mechanisms of neural degeneration. They have ultraviolet-sensitive (UVS) cones that are lost over most of the retina during development; only a small functional population remains in the dorsal retina. How this spatial distribution of UVS cones is maintained is unclear. Thyroxine (T4) induces UVS cone loss, and local thyroid hormone regulation was hypothesized to control UVS cone distribution. Thyroid hormone receptor alpha (TRalpha), thyroid hormone receptor beta (TRbeta) and Type 2 deiodinase (D2) regulate thyroid hormone exposure to target cells. Regional retinal expression of these genes was investigated during exogenous T4 treatment and natural smoltification of rainbow trout. Each retina from dark-adapted parr, T4-treated parr and natural smolts was divided into four quadrants, and total RNA was isolated. Quantitative real-time RT-PCR analysis demonstrated that all retinal quadrants had increased accumulation of TRbeta transcripts 2 days post-T4 treatment, corresponding to initiation of SWS1 opsin downregulation. Smolts exhibited decreased accumulation of TRalpha and TRbeta transcripts in all quadrants, but this effect was most pronounced in the dorso-temporal (DT) retinal quadrant where UVS cones persist. By contrast, in 2 day T4-treated parr, the DT quadrant showed increased expression of TRalpha and TRbeta. Furthermore, D2 transcripts decreased in the DT quadrant of T4-treated parr but increased in the DT quadrant of smolts. These results suggest that T4 upregulates TRbeta expression to initiate SWS1 opsin downregulation, while TRalpha and TRbeta downregulation occurs to prevent natural loss of UVS cones from the DT retina.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,020

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,280
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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