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Enregistrement W2016618328 · doi:10.1002/chem.201002934

Immobilization of DNA on Magnetic Microparticles for Mercury Enrichment and Detection with Flow Cytometry

2011· article· en· W2016618328 sur OpenAlexaffabout
Po‐Jung Jimmy Huang, Juewen Liu

Notice bibliographique

RevueChemistry - A European Journal · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced biosensing and bioanalysis techniques
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMercury (programming language)SYBR Green IChemistryFluorescenceAdsorptionStreptavidinBiosensorDetection limitAnalytical Chemistry (journal)ChromatographyBiotinBiochemistryReal-time polymerase chain reactionOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mercury detection in water has attracted a lot of research interest due to its highly toxic nature and adverse environmental impact. In particular, the recent discovery of specific binding of Hg(II) to thymine-rich (T-rich) DNA resulting in T-Hg(II)-T base pairs has led to the development of a number of sensors with different signaling mechanisms. However, the majority of such sensors were non-immobilized. Immobilization, on the other hand, allows active mercury adsorption, signal amplification, and sensor regeneration. In this work, we immobilized a thymine-rich DNA on a magnetic microparticle (MMP) surface through biotin-streptavidin interactions. In the presence of Hg(II), the DNA changes from a random coil structure into a hairpin, upon which SYBR Green I binds to emit green fluorescence. Detection was carried out by using flow cytometry where the fluorescence intensity increased ≈9-fold in the presence of mercury and the binding of mercury reached equilibrium in less than 2 min. The sensor showed a unique sample-volume-dependent fluorescence signal change where a higher fluorescence was obtained with a larger sample volume, suggesting that the particles can actively adsorb Hg(II). Detection limits of 5 nM (1 ppb) and 14 nM (2.8 ppb) were achieved in pure buffer and in mercury-spiked Lake Ontario water samples, respectively.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations33
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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