MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2016912832 · doi:10.1155/2008/369601

The Generation Challenge Programme Platform: Semantic Standards and Workbench for Crop Science

2008· article· en· W2016912832 sur OpenAlexaff
Richard Bruskiewich, Martin Senger, Guy Davenport, Manuel Ruíz, Mathieu Rouard, Tom Hazekamp, Masaru Takeya, Koji Doi, Kouji Satoh, Marcos Mota do Carmo Costa, Reinhard Simon, Jayashree Balaji, Akinnola N. Akintunde, Ramil Mauleon, Samart Wanchana, Trushar Shah, Mylah Anacleto, Arllet Portugal, Victor Jun Ulat, Supat Thongjuea, Kyle Braak, Sebastian Ritter, Alexis Dereeper, Milko Skofic, Edwin Ruiz Rojas, N. F. Martins, Γεώργιος Παππάς, Ryan Alamban, Roque Almodiel, Lord Hendrix Barboza, Jeffrey Detras, Kevin Manansala, Michael J. Mendoza, Jeffrey Morales, Barry Peralta, Rowena Valerio, Yi Zhang, Sergio Alonso y Gregorio, Joseph Anthony C. Hermocilla, Michael Echavez, Jan Michael C. Yap, Andrew Farmer, Gary Schiltz, Jennifer Lee, Terry Casstevens, Pankaj Jaiswal, Ayton Meintjes, Mark D. Wilkinson, Benjamin M. Good, James Wagner, Jane Morris, David Marshall, Anthony Collins, Shoshi Kikuchi, Thomas Metz, Graham McLaren, T.J.L. van Hintum

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Plant Genomics · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Phylogenetic Studies
Établissements canadiensSimon Fraser UniversityBC Cancer AgencyUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesWageningen University and ResearchConsortium of International Agricultural Research CentersCentre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement
Mots-clésInteroperabilityWorkbenchComputer scienceSuiteOntologyMiddleware (distributed applications)Domain (mathematical analysis)ImplementationData scienceWorld Wide WebData accessDatabaseSoftware engineeringData mining

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Generation Challenge programme (GCP) is a global crop research consortium directed toward crop improvement through the application of comparative biology and genetic resources characterization to plant breeding. A key consortium research activity is the development of a GCP crop bioinformatics platform to support GCP research. This platform includes the following: (i) shared, public platform-independent domain models, ontology, and data formats to enable interoperability of data and analysis flows within the platform; (ii) web service and registry technologies to identify, share, and integrate information across diverse, globally dispersed data sources, as well as to access high-performance computational (HPC) facilities for computationally intensive, high-throughput analyses of project data; (iii) platform-specific middleware reference implementations of the domain model integrating a suite of public (largely open-access/-source) databases and software tools into a workbench to facilitate biodiversity analysis, comparative analysis of crop genomic data, and plant breeding decision making.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,816
Score d'incertitude au seuil0,230

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueInternational Journal of Plant GenomicsMême sujetGenomics and Phylogenetic StudiesTravaux en français237 207