Functional characterization of a 13-bp deletion (c.-1522_-1510del13) in the promoter of the von Willebrand factor gene in type 1 von Willebrand disease
Notice bibliographique
Résumé
We have studied the effect of a 13-bp deletion in the promoter of the von Willebrand factor (VWF) gene in a patient with type 1 von Willebrand disease. The index case has a VWF:Ag of 0.49 IU/mL and is heterozygous for the deletion. The deletion is located 48 bp 5' of the transcription start site, and in silico analysis, electrophoretic mobility shift assays, and chromatin immunoprecipitation studies all predict aberrant binding of Ets transcription factors to the site of the deletion. Transduction of reporter gene constructs into blood outgrowth endothelial cells showed a 50.5% reduction in expression with the mutant promoter (n = 16, P < .001). A similar 40% loss of transactivation was documented in transduced HepG2 cells. A similar marked reduction of transgene expression was shown in the livers of mice injected with the mutant promoter construct (n = 8, P = .003). Finally, in studies of BOEC mRNA, the index case showed a 4.6-fold reduction of expression of the VWF transcript associated with the deletion mutation. These studies show that the 13-bp deletion mutation alters the binding of Ets (and possibly GATA) proteins to the VWF promoter and significantly reduces VWF expression, thus playing a central pathogenic role in the type 1 von Willebrand disease phenotype in the index case.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».