Unfolded Protein Response (UPR): Cellular control for our errors in life
Notice bibliographique
Résumé
The unfolding protein response (UPR) is critical for the maintenance of cellular function under endoplasmic reticulum (ER) stress. Under stress conditions, proteins in the ER may misfold and accumulate into aggregates. To prevent aggregate accumulation, BiP is released from ATF6, IRE1 or PERK to bind to the misfolded proteins and assist in ATP mediated chaperone refolding. With the loss of BiP, ATF6 travels to the Golgi and is cleaved to a nucleus targeting form that promotes expression of UPR-responsive genes. IRE1 homodimerizes upon release of BiP to form an active RNase domain that removes an intron sequence from the XBP1 mRNA transcript. XBP1 is another promoter protein that is also responsible for UPR gene transcription. PERK homodimerizes upon BiP release and forms an active kinase domain that attenuates general translation and increases translation of specific UPR transcripts. Under prolonged UPR stimulation, IRE1 signals for proteins responsible for ER associated degradation. These proteins remove the misfolded proteins from the ER and bring them to the proteasome for degradation. If the misfolded proteins are not refolded or cleared from the ER, then the cell may be targeted for apoptosis. False UPR signals or accumulation of mutant or misfolded proteins in the ER lead to many diseases. Understanding the UPR pathway and signals that are involved may offer a template for designing novel therapeutics to help alleviate the symptoms of misfolding diseases or assist in refolding these proteins.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,003 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».