Prevalence of Anaerobic Ammonium-Oxidizing Bacteria in Contaminated Groundwater
Notice bibliographique
Résumé
Anaerobic ammonium-oxidizing (anammox) bacteria perform an important step in the global nitrogen cycle: anaerobic oxidation of ammonium and reduction of nitrite to form dinitrogen gas (N(2)). Anammox organisms appear to be widely distributed in natural and artificial environments. However, their roles in groundwater ammonium attenuation remain unclear and only limited biomarker-based data confirmed their presence prior to this study. We used complementary molecular and isotope-based methods to assess anammox diversity and activity occurring at three ammonium-contaminated groundwater sites: quantitative PCR, denaturing gradient gel electrophoresis, sequencing of 16S rRNA genes, and (15)N-tracer incubations. Here we show that anammox performing organisms were abundant bacterial community members. Although all sites were dominated by Candidatus Brocadia-like sequences, the community at one site was particularly diverse, possessing four of five known genera of anammox bacteria. Isotope data showed that anammox produced up to 18 and 36% of N(2) at these sites. By combining molecular and isotopic results we have demonstrated the diversity, abundance, and activity of these autotrophic bacteria. Our results provide strong evidence for their important biogeochemical role in attenuating groundwater ammonium contamination.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,003 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».