MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2017215338 · doi:10.1093/nar/gkt134

The PARP3- and ATM-dependent phosphorylation of APLF facilitates DNA double-strand break repair

2013· article· en· W2017215338 sur OpenAlexafffund
Amanda L. Fenton, Purnata Shirodkar, Chloe J. Macrae, Meng Li, Christine Koch

Notice bibliographique

RevueNucleic Acids Research · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePARP inhibition in cancer therapy
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreUniversity Health NetworkOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchTerry Fox Foundation
Mots-clésBiologyDNAPhosphorylationCell biologyGeneticsDNA repairDNA-binding proteinComputational biologyMolecular biologyBiophysicsGeneTranscription factor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

APLF is a forkhead associated-containing protein with poly(ADP-ribose)-binding zinc finger (PBZ) domains, which undergoes ionizing radiation (IR)-induced and Ataxia-Telangiectasia Mutated (ATM)-dependent phosphorylation at serine-116 (Ser(116)). Here, we demonstrate that the phosphorylation of APLF at Ser(116) in human U2OS cells by ATM is dependent on poly(ADP-ribose) polymerase 3 (PARP3) levels and the APLF PBZ domains. The interaction of APLF at sites of DNA damage was diminished by the single substitution of APLF Ser(116) to alanine, and the cellular depletion or chemical inhibition of ATM or PARP3 also altered the level of accumulation of APLF at sites of laser-induced DNA damage and impaired the accumulation of Ser(116)-phosphorylated APLF at IR-induced γH2AX foci in human cells. The data further suggest that ATM and PARP3 participate in a common signalling pathway to facilitate APLF-Ser(116) phosphorylation, which, in turn, appears to be required for efficient DNA double-strand break repair kinetics and cell survival following IR. Collectively, these findings provide a more detailed understanding of the molecular pathway that leads to the phosphorylation of APLF following DNA damage and suggest that Ser(116)-APLF phosphorylation facilitates APLF-dependent double-strand break repair.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,219
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,058
Tête enseignante GPT0,359
Écart entre enseignants0,300 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations63
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueNucleic Acids ResearchMême sujetPARP inhibition in cancer therapyTravaux en français237 207