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Enregistrement W2017261045 · doi:10.1158/1055-9965.epi-09-0055

Sam-Pointed Domain Containing Ets Transcription Factor in Luminal Breast Cancer Pathogenesis

2009· article· en· W2017261045 sur OpenAlexaff
Ashwani Sood, Jianmin Wang, Paulette Mhawech‐Fauceglia, Bagirathan Jana, Ping Liang, Joseph Geradts

Notice bibliographique

RevueCancer Epidemiology Biomarkers & Prevention · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Cells and Metastasis
Établissements canadiensImmunovaccine (Canada)
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteU.S. Department of Defense
Mots-clésCancer researchBreast cancerBiologyCarcinogenesisEstrogen receptorTranscription factorETS transcription factor familyTransfectionCancerCell cultureGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We previously described frequent overexpression of Sam-pointed domain containing Ets transcription factor (SPDEF), also known as PDEF, in human breast cancer, and suggested a role for this transcription factor in breast tumor progression. To seek evidence in support of this hypothesis, the MCF-12A breast epithelial cell line was transfected with an SPDEF expression plasmid or with control vector plasmid and the transfected cells tested for their tumorigenic growth in vivo. The data showed that SPDEF expression in MCF-12A cells induced accelerated tumor growth in severe combined immune deficient mice compared with vector-transfected MCF-12A cells. Furthermore, Gene Expression Omnibus and Oncomine databases were mined to determine any correlation between SPDEF expression levels and clinical outcome. High SPDEF expression correlated with poor overall survival of patients with estrogen receptor+ breast cancer, in three independent data sets. In contrast, little correlation was observed between SPDEF expression and cancer relapse or remote metastases. SPDEF expression was further found to be restricted to tumors arising in the luminal epithelial lineage including estrogen receptor+ luminal subtype breast tumors, Her2/neu-positive tumors, and apocrine carcinomas. In contrast, little SPDEF expression was found in the basal subtype of breast tumors. Based on these results, we hypothesize that SPDEF has a function in the specification of the progenitor cells of the luminal epithelial lineage that become targets of oncogenesis in luminal breast cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,664
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,056
Tête enseignante GPT0,368
Écart entre enseignants0,312 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations30
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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