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Enregistrement W2017341397 · doi:10.1094/pdis-09-11-0728

First Report of Quinoa Downy Mildew Caused by <i>Peronospora variabilis</i> in the United States

2011· article· en· W2017341397 sur OpenAlexaboutno aff
Anna L. Testen, J. M. McKemy, P. A. Backman

Notice bibliographique

RevuePlant Disease · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Pathogens and Resistance
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDowny mildewSporangiumBiologyChenopodium quinoaChlorosisOosporeBotanySporeInoculationHorticultureInternal transcribed spacerIntergenic regionRibosomal RNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Quinoa, Chenopodium quinoa Willd., is an Andean crop prized for its high nutritional value and adaptability to harsh environments. Quinoa is plagued by downy mildew caused by Peronospora variabilis Gäum (formerly Peronospora farinosa f. sp. chenopodii Byford) (1). Quinoa production has spread beyond native Andean ranges and quinoa downy mildew has been reported in India, Canada, and Denmark (1). During the summer of 2011, quinoa trials were established to determine the ability of quinoa to grow under Mid-Atlantic conditions and monitor for regional disease problems. In July, after cool, rainy conditions, downy mildew-like symptoms were observed on quinoa at research plots in Centre and Lancaster counties of Pennsylvania. Symptoms and signs consisted of irregularly shaped areas of foliar chlorosis or pink discoloration accompanied by dense, gray sporulation on both leaf surfaces. Sporangia were tan to gray-brown, semi-ovoid, often with a pedicel, mean length of 31 μm, and mean width of 23 μm. Sporangiophores branched dichotomously, and the terminal branchlets curved and tapered to a point. Orange oospores were present in field samples of leaf tissue. DNA was extracted from infected foliar tissue and sporangial suspensions. A seminested PCR protocol (2) was used to obtain partial internal transcribed spacer (ITS) sequences of six Peronospora isolates. The sequences shared 99% maximum identity to a known P. variabilis accession (FM863721.2) in GenBank. A voucher specimen was deposited into the U.S. National Fungus Collections (BPI 882064). Pathogenicity of each of two strains of P. variabilis was confirmed by inoculating quinoa with sporangia (4). Sporangia were shaken from leaves in sterile distilled water and the suspension was filtered through cheesecloth. A 0.01% Tween solution was added and the suspension diluted to 10 3 sporangia/ml. With an atomizer, a 10-ml sporangial suspension (or sterile water for noninoculated control plants) was sprayed onto one flat of 18 2-week-old quinoa plants, and relative humidity was increased to saturation using a humidity dome for 24 h. After 1 week, chlorosis and pink discoloration were noted on leaves of inoculated quinoa, and after 18 h of subsequent increased humidity (&gt;95% relative humidity), dense gray sporulation was observed. No symptoms were noted on noninoculated control plants. Sporangia and sporangiophores were examined morphologically and confirmed to be P. variabilis, confirming Koch's postulates. For culture maintenance, 2-week-old quinoa leaves were placed onto a sporangial suspension on top of 1% water agar and maintained in a growth chamber at 20°C with 16 h of light per day. Quinoa downy mildew is seedborne (3) and initial infections may have occurred from oospores in the pericarp, despite intensive processing of consumable quinoa seeds to remove saponins. To our knowledge, this is the first report of quinoa downy mildew in the United States and also the first report of P. variabilis in the United States. References: (1) Y. Choi et al. Mycopathologia 169:403, 2010. (2) D. Cooke et al. Fungal Genet. Biol. 30:17, 2000. (3) S. Danielson et al. Seed Sci. Technol. 32:91, 2004. (4) J. Ochoa et al. Plant Pathol. 48:425, 1999.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,191
Score d'incertitude au seuil0,250

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,187
Écart entre enseignants0,167 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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