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Enregistrement W2017346489 · doi:10.1099/vir.0.81160-0

Cysteine residues of the porcine reproductive and respiratory syndrome virus small envelope protein are non-essential for virus infectivity

2005· article· en· W2017346489 sur OpenAlexafffund
Changhee Lee, Dongwan Yoo

Notice bibliographique

RevueJournal of General Virology · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueAnimal Virus Infections Studies
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaPfizerU.S. Department of Agriculture
Mots-clésPorcine reproductive and respiratory syndrome virusBiologyVirologyOpen reading frameArterivirusCysteineVirusNidoviralesInfectivityViral replicationMolecular biologyGenePeptide sequenceGeneticsBiochemistryEnzymeInfectious disease (medical specialty)Coronavirus disease 2019 (COVID-19)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSV) open reading frame (ORF) 2a contains a small internal ORF (2b) capable of encoding a protein of 73 aa, termed E protein. The function of E protein is currently unknown. The E protein possesses two cysteines at positions 49 and 54 that are highly conserved among North American isolates. In the present study, it was shown that E protein did not homodimerize with itself nor did it heterodimerize with the nucleocapsid (N) protein. However, E protein was interactive non-covalently with itself or with the N protein as shown by pull-down assays. The significance of the E protein cysteine residues on virus replication was determined using an infectious clone. Each cysteine was substituted by serine and the mutations were introduced into a full-length clone of PRRSV. When transfected into Marc-145 cells, all cysteine mutant clones induced PRRSV-specific cytopathic effects and produced infectious progeny virus. The data indicate that cysteine residues in the E protein are not essential for replication of North American genotype PRRSV.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,766
Score d'incertitude au seuil0,239

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations37
Publié2005
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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