MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2017409907 · doi:10.1002/ajmg.a.20466

Novel SCO2 mutation (G1521A) presenting as a spinal muscular atrophy type I phenotype

2003· article· en· W2017409907 sur OpenAlexafffund
Mark A. Tarnopolsky, Jacqueline M. Bourgeois, M‐H. Fu, Г. В. Катаева, Jill Shah, David K. Simon, Douglas J. Mahoney, D. Johns, N. MacKay, B. H. Robinson

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Medical Genetics Part A · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeurogenetic and Muscular Disorders Research
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenUniversity of TorontoMcMaster University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchMcMaster UniversityHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésSpinal muscular atrophyLactic acidosisCompound heterozygosityCytochrome c oxidaseSMA*BiologyExonMuscle biopsyHypotoniaPathologyMutationMolecular biologyInternal medicineEndocrinologyMedicineGeneticsGeneBiopsyMitochondrion

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Rare cases of suspected spinal muscular atrophy (SMA) have been found to have cytochrome c oxidase (COX) deficiency. To date, four cases with SMA features have been reported in children with mutations in the synthesis of cytochrome oxidase 2 (SCO2) gene. We report a male neonate who was born hypotonic, with persistent lactic acidosis, spontaneous activity with EMG testing, development of respiratory distress in the first few hours of life, and died at 30 days of age with progressive cardiomyopathy. Testing for survival motor neurone (smn) and NAIP deletions were negative and a skeletal muscle biopsy showed neurogenic features with severe reductions of COX enzymatic and histochemical staining intensity. Post-mortem muscle, heart, and liver biopsies showed severe, moderate, and mild reductions in COX activity, respectively, with parallel findings in the protein content for the mitochondrial DNA (COII) and nuclear DNA (COIV) encoded subunits. DNA sequencing of exon 2 of the SCO2 gene revealed compound heterozygosity with mutations at G1541A (common mutation, E140K) and also at a novel site in the copper binding region (G1521A in the current case (converting a highly conserved cysteine to tyrosine [corrected] (C133Y) [corrected]); mother heterozygous for G1521A; and father heterozygous for G1541A). This case provides strong support that SCO2 mutations can result in neonatal hypotonia with an SMA 1 phenotype. SCO2 mutations should be screened in suspected SMA cases with normal smn mutation analysis and any one of; cardiomyopathy, lactic acidosis, or COX deficiency in muscle.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,843
Score d'incertitude au seuil0,589

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,351
Écart entre enseignants0,323 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeAutre devis
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations55
Publié2003
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueAmerican Journal of Medical Genetics Part AMême sujetNeurogenetic and Muscular Disorders ResearchTravaux en français237 207