YB-1 promotes strand separation in vitro of duplex DNA containing either mispaired bases or cisplatin modifications, exhibits endonucleolytic activities and binds several DNA repair proteins
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Notice bibliographique
Résumé
YB-1 is a multifunctional protein involved in the regulation of transcription, translation, mRNA splicing and probably DNA repair. It contains a conserved cold shock domain and it binds strongly to inverted CCAAT box of different promoters. In this study, we have found that purified YB-1 oligomerizes readily in solutions to form trimers, hexamers and oligomers of 12 molecules. The presence of ATP changed the conformation of YB-1 in such a way that only dimers were detected by gel filtration analyses. Purified YB-1 can separate different DNA duplexes containing blunt ends, 5' or 3' recessed ends, or forked structures. This strand separation activity is increased on cisplatin-modified DNA or with duplex molecules containing mismatches. In addition to its exonuclease activity, YB-1 exhibits endonucleolytic activities in vitro. Finally, YB-1 affinity chromatography experiments have indicated that in addition to prespliceosome factors like nucleolin and ALY, YB-1 binds the DNA repair proteins MSH2, DNA polymerase delta, Ku80 and WRN proteins in vitro. Furthermore, immunofluorescence studies have shown that YB-1 re-localizes from the cytoplasm to nuclear areas containing either Ku80 or MSH2 proteins in human 293 embryonic kidney cells. These results suggest that YB-1 is involved in base excision and mismatch repair pathways.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle