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Enregistrement W2017433972 · doi:10.1111/j.1558-5646.2009.00658.x

EXTENSIVE VARIATION IN NATURAL COMPETENCE IN<i>HAEMOPHILUS INFLUENZAE</i>

2009· article· en· W2017433972 sur OpenAlexafffund
Heather Maughan, Rosemary J. Redfield

Notice bibliographique

RevueEvolution · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Phylogenetic Studies
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthKillam Trusts
Mots-clésBiologyDNAGeneticsNatural selectionGeneHaemophilus influenzaeGenetic variationCompetence (human resources)BacteriaSelection (genetic algorithm)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The ability of some bacteria to take up and recombine DNA from the environment is an important evolutionary problem because its function is controversial; although populations may benefit in the long-term from the introduction of new alleles, cells also reap immediate benefits from the contribution of DNA to metabolism. To clarify how selection has acted, we have characterized competence in natural isolates of H. influenzae by measuring DNA uptake and transformation. Most of the 34 strains we tested became competent, but the amounts of DNA they took up and recombined varied more than 1000-fold. Differences in recombination were not due to sequence divergence and were only partly explained by differences in the amounts of DNA taken up. One strain was highly competent during log phase growth, unlike the reference strain Rd, but several strains did not develop competence under any of the tested conditions. Analysis of competence genes identified genetic defects in two poorly transformable strains. These results show that strains can differ considerably in the amount of DNA they take up and recombine, indicating that the benefit associated with competence is likely to vary in space and/or time.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,976
Score d'incertitude au seuil0,349

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations75
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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