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Enregistrement W2017469118 · doi:10.1111/j.1574-6968.2000.tb09360.x

Sequencing and characterization of a novel serine metalloprotease from Burkholderia pseudomallei

2000· article· en· W2017469118 sur OpenAlexaff
May-Ann Lee, Yi‐Chun Liu

Notice bibliographique

RevueFEMS Microbiology Letters · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBurkholderia infections and melioidosis
Établissements canadiensNational Defence Medical Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBurkholderia pseudomalleiBiologyMicrobiologyProteasesVirulenceSerine proteaseBurkholderiaPeptide sequenceProteaseOpen reading frameNucleic acid sequenceTMPRSS6HemolysinLecithinaseBacteriaGeneticsGeneBiochemistryEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Burkholderia pseudomallei, a Gram-negative bacterium is found in the soil and water, mainly in Southeast Asia and Northern Australia. It is responsible for melioidosis in human and animals. The bacteria produce several potential virulent factors such as extracellular protease, hemolysin, lipase and lecithinase. The isolation of virulence genes and the study of their functions will contribute to our understanding of bacterial pathogenesis. Previous studies have implicated protease as a contributing virulence factor in the pathogenesis of some bacteria. Three out of 5000 clones screened from a genomic DNA library of B. pseudomallei were found to express protease activity. The clones were found to have the same sequence. The nucleotide sequence revealed an open reading frame (designated as metalloprotease A, mprA) encoding a 500-amino acid protein, MprA, with an estimated molecular mass of 50241 Da. The predicted amino acid sequence shares homology with the subtilisin family of serine proteases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,094
Score d'incertitude au seuil0,983

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations51
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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