MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2017544790 · doi:10.1063/1.1598191

A simple polarizable model of water based on classical Drude oscillators

2003· article· en· W2017544790 sur OpenAlexaff
Guillaume Lamoureux, Alexander D. MacKerell, Benoı̂t Roux

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Chemical Physics · 2003
Typearticle
Langueen
DomainePhysics and Astronomy
ThématiqueSpectroscopy and Quantum Chemical Studies
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPolarizabilityWater dimerWater modelDrude modelChemistryMolecular dynamicsDipolePoint particleThermodynamicsIntermolecular forceHarmonic oscillatorDielectricMolecular physicsAtomic physicsMoleculeComputational chemistryHydrogen bondPhysicsClassical mechanicsCondensed matter physicsQuantum mechanics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A simple polarizable water model is developed and optimized for molecular dynamics simulations of the liquid phase under ambient conditions. The permanent charge distribution of the water molecule is represented by three point charges: two hydrogen sites and one additional M site positioned along the HOH bisector. Electronic induction is represented by introducing a classical charged Drude particle attached to the oxygen by a harmonic spring. The oxygen site carries an equal and opposite charge, and is the center of an intermolecular Lennard-Jones interaction. The HOH gas-phase experimental geometry is maintained rigidly and the dipole of the isolated molecule is 1.85 D, in accord with experiment. The model is simulated by considering the dynamics of an extended Lagrangian in which a small mass is attributed to the Drude particles. It is parametrized to reproduce the salient properties of liquid water under ambient conditions. The optimal model, refered to as SWM4-DP for “simple water model with four sites and Drude polarizability,” yields a vaporization enthalpy of 10.52 kcal/mol, a molecular volume of 29.93 Å3, a static dielectric constant of 79±5, a self-diffusion constant of (2.30±0.04)×10−5 cm2/s, and an air/water surface tension of 66.9±0.9 dyn/cm, all in excellent accord with experiments. The energy of the water dimer is −5.18 kcal/mol, in good accord with estimates from experiments and high level ab initio calculations. The polarizability of the optimal model is 1.04 Å3, which is smaller than the experimental value of 1.44 Å3 in the gas phase. It is likely that such a reduced molecular polarizability, which is essential to reproduce the properties of the liquid, arises from the energy cost of overlapping electronic clouds in the condensed phase due to Pauli’s exclusion principle opposing induction.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0030,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations690
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe Journal of Chemical PhysicsMême sujetSpectroscopy and Quantum Chemical StudiesTravaux en français237 207