Messenger RNAs in metaphase II oocytes correlate with successful embryo development to the blastocyst stage
Notice bibliographique
Résumé
The mRNAs accumulated in oocytes provide support for embryo development until embryo genomic activation. We hypothesized that the maternal mRNA stock present in bovine oocytes is associated with embryo development until the blastocyst stage. To test our hypothesis, we analyzed the transcriptome of the oocyte and correlated the results with the embryo development. Our goal was to identify genes expressed in the oocyte that correlate with its ability to develop to the blastocyst stage. A fraction of oocyte cytoplasm was biopsied using micro-aspiration and stored for further expression analysis. Oocytes were activated chemically, cultured individually and classified according to their capacity to develop in vitro to the blastocyst stage. Microarray analysis was performed on mRNA extracted from the oocyte cytoplasm fractions and correlated with its ability to develop to the blastocyst stage (good quality oocyte) or arrest at the 8-16-cell stage (bad quality oocyte). The expression of 4320 annotated genes was detected in the fractions of cytoplasm that had been collected from oocytes matured in vitro. Gene ontology classification revealed that enriched gene expression of genes was associated with certain biological processes: 'RNA processing', 'translation' and 'mRNA metabolic process'. Genes that are important to the molecular functions of 'RNA binding' and 'translation factor activity, RNA binding' were also enriched in oocytes. We identified 29 genes with differential expression between the two groups of oocytes compared (good versus bad quality). The content of mRNAs expressed in metaphase II oocytes influences the activation of the embryonic genome and enables further develop to the blastocyst stage.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».