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Enregistrement W2017693326 · doi:10.1083/jcb.201409026

PAPC mediates self/non–self-distinction during Snail1-dependent tissue separation

2015· article· en· W2017693326 sur OpenAlexafffund
Olivia Luu, Erich W. Damm, Debanjan Barua, Tamara H. L. Smith, Jason Wen, Stéphanie Lepage, Martina Nagel, Hady Ibrahim-Gawel, Yunyun Huang, Ashley E.E. Bruce, Rudolf Winklbauer

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Cell Biology · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueWnt/β-catenin signaling in development and cancer
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésEctodermMesodermBiologyAdherens junctionCell biologyGerm layerParaxial mesodermGastrulationXenopusLateral plate mesodermNODALHomeoboxNeuroectodermWnt signaling pathwayTranscription factorCadherinAnatomyEmbryogenesisSignal transductionCellGeneticsEmbryoEmbryonic stem cell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cleft-like boundaries represent a type of cell sorting boundary characterized by the presence of a physical gap between tissues. We studied the cleft-like ectoderm-mesoderm boundary in Xenopus laevis and zebrafish gastrulae. We identified the transcription factor Snail1 as being essential for tissue separation, showed that its expression in the mesoderm depends on noncanonical Wnt signaling, and demonstrated that it enables paraxial protocadherin (PAPC) to promote tissue separation through two novel functions. First, PAPC attenuates planar cell polarity signaling at the ectoderm-mesoderm boundary to lower cell adhesion and facilitate cleft formation. Second, PAPC controls formation of a distinct type of adhesive contact between mesoderm and ectoderm cells that shows properties of a cleft-like boundary at the single-cell level. It consists of short stretches of adherens junction-like contacts inserted between intermediate-sized contacts and large intercellular gaps. These roles of PAPC constitute a self/non-self-recognition mechanism that determines the site of boundary formation at the interface between PAPC-expressing and -nonexpressing cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations30
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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