Notice bibliographique
Résumé
Fungi and viruses encode a variety of peptidases having a plethora of functions. Many fungal peptidases are extracellular and are likely used to degrade proteins in their environment. Viral peptidases are processing enzymes, intimately involved in the virus infectious cycle. The viral RNA genome is translated by the host-cell machinery into a large polyprotein that is cleaved by the viral peptidases into mature capsid proteins, non-structural proteins and enzymes. I review the structure and catalytic mechanism of scytalidoglutamic peptidase isolated from the wood-destroying fungus Scytalidium lignicolum. This enzyme has a unique beta-sandwich fold and a novel catalytic mechanism based on a glutamate, a glutamine and a nucleophilic water molecule. Hepatitis A virus (HAV) 3C peptidase was the first structure identified for a viral 3C enzyme that exhibited the three-dimensional fold of the chymotrypsin family of serine peptidases but had a cysteine sulfur atom instead of the serine oxygen as the nucleophile. The structure of HAV 3C was unusual in that the Asp residue expected as the third member of the catalytic triad did not interact with the general base His. The present structure is of a beta-lactone-inhibited version of HAV 3C that has a restored catalytic triad.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».