Morphological and phylogenetic identification of <i>Botrytis sinoviticola</i> , a novel cryptic species causing gray mold disease of table grapes ( <i>Vitis vinifera</i> ) in China
Notice bibliographique
Résumé
Seventy-five isolates of Botrytis collected from table grapes (Vitis vinifera) with gray mold symptoms in China were identified based on morpho-cultural characteristics on potato dextrose agar (20 C) and/or phylogenetic analysis using the sequences of three nuclear genes (G3PDH, HSP60, RPB2). Isolates of different species of Botrytis were compared with fenhexamid sensitivity, Bc-hch gene-RFLP haplotyping and pathogenicity to V. vinifera. The 75 isolates comprise two species, B. cinerea (63 isolates) and an undescribed Botrytis sp. (12 isolates) described here as Botrytis sinoviticola Zhang et al. sp., nov. Both B. sinoviticola (Bs) and B. cinerea (Bc) were found to have 20 C optimum for mycelial growth and 25 C for conidial germination. Sensitivity to fenhexamid was significantly greater (P < 0.05) for Bc (EC50 = 0.04 ± 0.01 μg mL(-1)) than for Bs (EC50 = 0.08 ± 0.02 μg mL(-1)). Digestion of the PCR amplicons of the Bc-hch gene with Hha I generated two haplotypes, Group I haplotype for Bs and Group II haplotype for Bc. Bs infected table grapes (leaves, berries) only through wounds, whereas Bc infected both injured and non-injured tissues of table grapes. This study suggests that Bs is a cryptic species sympatric with Bc on table grapes in China.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».