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Enregistrement W2017789801 · doi:10.1038/emboj.2010.273

Recycling of peroxiredoxin IV provides a novel pathway for disulphide formation in the endoplasmic reticulum

2010· article· en· W2017789801 sur OpenAlexfundno aff
Timothy J. Tavender, Jennifer J Springate, Neil J. Bulleid

Notice bibliographique

RevueThe EMBO Journal · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEndoplasmic Reticulum Stress and Disease
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversity of GlasgowWellcome TrustMcGill University
Mots-clésEndoplasmic reticulumBiologyCell biologyPeroxiredoxinBiochemistryEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Disulphide formation in the endoplasmic reticulum (ER) is catalysed by members of the protein disulphide isomerase (PDI) family. These enzymes can be oxidized by the flavoprotein ER oxidoreductin 1 (Ero1), which couples disulphide formation with reduction of oxygen to form hydrogen peroxide (H(2)O(2)). The H(2)O(2) produced can be metabolized by ER-localized peroxiredoxin IV (PrxIV). Continuous catalytic activity of PrxIV depends on reduction of a disulphide within the active site to form a free thiol, which can then react with H(2)O(2). Here, we demonstrate that several members of the PDI family are able to directly reduce this PrxIV disulphide and in the process become oxidized. Furthermore, we show that altering cellular expression of these proteins within the ER influences the efficiency with which PrxIV can be recycled. The oxidation of PDI family members by PrxIV is a highly efficient process and demonstrates how oxidation by H(2)O(2) can be coupled to disulphide formation. Oxidation of PDI by PrxIV may therefore increase efficiency of disulphide formation by Ero1 and also allows disulphide formation via alternative sources of H(2)O(2).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations241
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentnon

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