An integrated method for mutation detection using on‐chip sample preparation, single‐stranded conformation polymorphism, and heteroduplex analysis
Notice bibliographique
Résumé
This work integrates rapid techniques for mutation detection by producing single-stranded DNA and (renatured) double-stranded DNA on-chip, labeling these with fluorescent DNA stains and then performing two complementary methods of mutation detection-single stranded conformation polymorphism (SSCP) analysis and heteroduplex analysis (HA). This involves the denaturation of double-stranded polymerase chain reaction (PCR) product into single-stranded DNA, the mutation analysis of the single-stranded DNA by SSCP and the rehybridized double-stranded DNA by HA. These steps were performed entirely on-chip within several minutes of operation. The combination of these two mutation detection methods on-chip provides a highly sensitive method of mutation detection for either genotyping or screening. Many mutation analysis methods rely upon fluorescently labeled samples from a PCR with fluorescently labeled primers. By labeling on-chip we not only attain improved signal strength, but the method is considerably more versatile. Although we used PCR products in this work, this method could be used to analyze DNA from any source. We believe that this combination of several procedures on a single chip represents a significant step in the development of higher levels of integration upon microfluidic devices.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».