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Enregistrement W2017921263 · doi:10.1139/g00-051

Genomic structure and sequence of the gilthead seabream (<i>Sparus aurata</i>) growth hormone-encoding gene: Identification of minisatellite polymorphism in intron I

2000· article· en· W2017921263 sur OpenAlexvenueno aff
R. Almuly, B. Z. Cavari, H Ferstman, Oren Kolodny, Bruria Funkenstein

Notice bibliographique

RevueGenome · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGrowth Hormone and Insulin-like Growth Factors
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUnited States - Israel Binational Agricultural Research and Development Fund
Mots-clésIntronBiologyGeneticsMinisatelliteGeneExonHormone response elementCatfishTandem repeatSequence analysisMolecular biologyMicrosatelliteGenomeAlleleEstrogen receptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The growth hormone (GH) gene of the gilthead seabream (Sparus aurata) (saGH) has been cloned, sequenced, and characterized. The saGH gene spans approximately 4.3 kb and consists of six exons and five introns, as found for all cloned teleost GH genes with the exception of carps and catfish. The first and third introns contain long stretches of repetitive tandem repeats. The second intron, which is unusually long compared with that in other teleosts (and other vertebrates) spans 1747 nucleotides (nt) and contains several inverted repeats. Intron-targeted polymerase chain reaction (PCR) analysis identified length polymorphism of the first intron. Sequence analysis of four variants (405, 424, 636, and 720 nt) out of many variants found revealed that the variation in length is due to differences in the number of repeat monomers (17-mer or 15-mer) as well as minor changes in their length. This repeat unit contains the consensus half-site motif of the thyroid hormone response element (TRE) and estrogen response element (ERE). Polymorphism was found also in the third intron. This is the first report of such high polymorphism of the first intron of GH gene in a vertebrate.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,794
Score d'incertitude au seuil0,667

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,232
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations57
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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