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Enregistrement W2017968087 · doi:10.1139/w03-078

Putative virulence factors are released in association with membrane vesicles from<i>Burkholderia cepacia</i>

2003· article· en· W2017968087 sur OpenAlexafffundvenue
Nick Allan, Cora Kooi, Pamela A. Sokol, Terry J. Beveridge

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCystic Fibrosis Research Advances
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesUniversity of British Columbia
Mots-clésBiologyPeriplasmic spaceVirulenceMicrobiologyPeptidoglycanBurkholderiaBacterial outer membraneBurkholderia pseudomalleiProteaseLysophospholipaseLipaseVesiclePhospholipaseBacteriaBiochemistryEnzymeMembraneEscherichia coli

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Like many other Gram-negative bacteria, Burkholderia cepacia naturally releases membrane vesicles (n-MVs) during normal growth. Through filtration and differential centrifugation, n-MVs from clinical isolates of the IIIa and V genomovars were isolated and their characteristics compared. Electron microscopy revealed that they were spherical, 30-220 nm in diameter, and bilayered. Virulence factors thought to play a role in pathogenicity (e.g., lipase, phospholipase-N, and protease, including a metalloprotease) were found associated with n-MVs, while peptidoglycan zymogram analysis also revealed 26, 28, 36, and 66 kDa peptidoglycan-degrading enzymes. n-MVs were often contaminated with flagella and pili when isolated by traditional methods, and a new strategy using a linear isopycnic sucrose gradient was utilized. For better characterization, this was applied to a representative genomovar IIIa strain (C5424) and showed that n-MVs consisted of a subset of specific outer membrane and periplasmic proteins as well as lipopoly saccharide possessing only a putative minor O-side chain polymer. This finding suggests that certain components are selected by B. cepacia during n-MV formation, and since some are putative virulence factors, this property could help deliver the factors to tissue, thereby aiding infection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations48
Publié2003
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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