MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2017973506 · doi:10.1159/000095162

Lipopolysaccharide and TNF-α Produce Very Similar Changes in Gene Expression in Human Endothelial Cells

2006· article· en· W2017973506 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueJournal of Vascular Research · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Response and Inflammation
Établissements canadiensRoyal Victoria HospitalMcGill University Health CentreRoyal Victoria Regional Health Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTumor necrosis factor alphaCD14BiologyAutocrine signallingLipopolysaccharideMolecular biologyGene expressionTLR4Microarray analysis techniquesCell adhesion moleculeChemokineSignal transductionCell biologyImmunologyReceptorGeneInflammationFlow cytometryBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Intracellular signaling pathways regulated by Toll-like receptor 4 (TLR4) and tumor necrosis factor-alpha (TNF-alpha) both activate NFkappaB. This suggests that lipopolysaccharide (LPS) and TNF-alpha should alter transcription of a common set of genes. We tested this hypothesis by treating first passage human umbilical endothelial cells (HUVEC) for 6 h with LPS (50 ng/ml+1 microg/ml CD14) or TNF-alpha (10 ng/ml) and analyzing changes in gene expression by microarray analysis (Affymetrix GeneChips). LPS and TNF-alpha increased expression of 191 common genes and decreased expression of 102 genes. Regulated transcripts encoded for a large number of chemokines, adhesion molecules, procoagulant factors, and molecules that affect cell integrity. Based on the microarray analysis and subsequent confirmation of specific genes by Northern analysis, all 203 genes altered by LPS were altered by TNF-alpha. An additional 17 genes were induced only by TNF-alpha and the expression of 46 was reduced. There were, however, some differences in the kinetics of changes. We also showed that endogenous CD14 was present on these early passage cells and exogenous CD14 was not necessary for most of the LPS response. An autocrine effect from LPS induced expression of TNF-alpha also was ruled out by blocking TNF-alpha with monoclonal antibodies. In conclusion, LPS induces a robust alteration in gene expression in HUVEC that is very similar to that induced by TNF-a. This LPS effect on endothelium could play an important role in the innate immune response.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil0,339

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,301
Écart entre enseignants0,276 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle