The Fission Yeast Copper-sensing Transcription Factor Cuf1 Regulates the Copper Transporter Gene Expression through an Ace1/Amt1-like Recognition Sequence
Notice bibliographique
Résumé
Transcriptional regulation of genes encoding critical components of copper transport is essential for copper homeostasis and growth in yeast. Analysis of regulatory regions in the promoter of the ctr4(+) copper transporter gene in fission yeast Schizosaccharomyces pombe reveals the identity of a conserved copper-signaling element (CuSE), which is recognized by the transcription factor Cuf1. We demonstrate that CuSE is necessary for transcriptional activation in response to copper deprivation conditions. Interestingly, the CuSE element bears a strong sequence similarity to the recognition site, denoted MRE (metal regulatory element), which is recognized by a distinct class of copper sensors required for copper detoxification, including Ace1 from Saccharomyces cerevisiae and Amt1 from Candida glabrata. When a consensus MRE from S. cerevisiae is introduced into S. pombe, transcription is induced by copper deprivation in a Cuf1-dependent manner, similar to regulation by Mac1, the nuclear sensor for regulating the expression of genes encoding components involved in copper transport in S. cerevisiae. UV-cross-linking experiments show that the Cuf1 protein directly binds the CuSE. These results demonstrate that the Cuf1 nutritional copper-sensing factor possesses a module that functions similarly to domains found in the Ace1/Amt1 class of metalloregulatory factors, which allows the protein to act through a closely related MRE-like sequence to regulate copper transport gene expression in S. pombe.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».