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Enregistrement W2018128025 · doi:10.1073/pnas.0706537105

RNAi-mediated suppression of <i>p</i> -coumaroyl-CoA 3′-hydroxylase in hybrid poplar impacts lignin deposition and soluble secondary metabolism

2008· article· en· W2018128025 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Gene Expression Analysis
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesOffice of SciencePurdue UniversityU.S. Department of Energy
Mots-clésPhenylpropanoidLigninShikimate pathwayChemistryHydroxylationBiochemistryMonooxygenaseCell wallHydroxycinnamic acidMetabolismSecondary metabolismBiosynthesisCytochrome P450EnzymeOrganic chemistryAntioxidant

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

p-Coumaroyl-CoA 3'-hydroxylase (C3'H) is a cytochrome P450-dependent monooxygenase that catalyzes the 3'-hydroxylation of p-coumaroyl shikimate and p-coumaroyl quinate. We used RNA interference to generate transgenic hybrid poplar suppressed in C3'H expression and analyzed them with respect to transcript abundance, cell wall structure and chemical composition, and soluble metabolite levels. RT-PCR expression profiles confirmed the down-regulation of C3'H in a number of lines, which generally correlated very well with reduced total cell wall lignin content. The most strongly repressed line was chosen for further analysis and compared with the wild-type trees. In-depth characterization revealed that along with the significant decrease in total lignin content, a significant shift in lignin monomer composition was observed, favoring the generation of p-hydroxyphenyl units at the expense of guaiacyl units while the proportion of syringyl moieties remained constant. Suppression of C3'H also resulted in the accumulation of substantial pools of 1-O-p-coumaroyl-beta-d-glucoside and other phenylpropanoid glycosides, and p-coumaroyl shikimate, providing further insight into the role of C3'H in the lignin biosynthetic pathway. The data presented indicate that when down-regulated, C3'H becomes a rate-limiting step in lignin biosynthesis and further support the involvement of hydroxycinnamic acid shikimate esters in the lignin biosynthetic pathway.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil0,276

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle