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Enregistrement W2018153321 · doi:10.1074/jbc.m608179200

Reversible Sequestration of Active Site Cysteines in a 2Fe-2S-bridged Dimer Provides a Mechanism for Glutaredoxin 2 Regulation in Human Mitochondria

2006· article· en· W2018153321 sur OpenAlexfundno aff
C. Johansson, K.L. Kavanagh, O. Gileadi, Udo Oppermann

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRedox biology and oxidative stress
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesKnut och Alice Wallenbergs StiftelseKarolinska InstitutetCanadian Institutes of Health ResearchGenome CanadaOntario Innovation TrustWellcome TrustGlaxoSmithKline
Mots-clésGlutaredoxinDimerMitochondrionMechanism (biology)ChemistryActive siteBiophysicsStereochemistryBiochemistryBiologyOxidative stressPhysicsCatalysisThioredoxin

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Human mitochondrial glutaredoxin 2 (GLRX2), which controls intracellular redox balance and apoptosis, exists in a dynamic equilibrium of enzymatically active monomers and quiescent dimers. Crystal structures of both monomeric and dimeric forms of human GLRX2 reveal a distinct glutathione binding mode and show a 2Fe-2S-bridged dimer. The iron-sulfur cluster is coordinated through the N-terminal active site cysteine, Cys-37, and reduced glutathione. The structures indicate that the enzyme can be inhibited by a high GSH/GSSG ratio either by forming a 2Fe-2S-bridged dimer that locks away the N-terminal active site cysteine or by binding non-covalently and blocking the active site as seen in the monomer. The properties that permit GLRX2, and not other glutaredoxins, to form an iron-sulfur-containing dimer are likely due to the proline-to-serine substitution in the active site motif, allowing the main chain more flexibility in this area and providing polar interaction with the stabilizing glutathione. This appears to be a novel use of an iron-sulfur cluster in which binding of the cluster inactivates the protein by sequestering active site residues and where loss of the cluster through changes in subcellular redox status creates a catalytically active protein. Under oxidizing conditions, the dimers would readily separate into iron-free active monomers, providing a structural explanation for glutaredoxin activation under oxidative stress.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations143
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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