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Enregistrement W2018256019 · doi:10.1021/acs.biochem.5b00156

Biochemical Characterization of the Roles of Glycines 24 and 27 and Threonine 179 in Tropomyosin from the Fast Skeletal Trunk Muscle of the Atlantic Salmon

2015· article· en· W2018256019 sur OpenAlexafffund
Korrina R. Fudge, David H. Heeley

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiomyopathy and Myosin Studies
Établissements canadiensMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésTropomyosinBiochemistryMutantThreonineCleavage (geology)MyosinBiologyAlanineProteolysisSerineAmino acidChemistryBiophysicsEnzymeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Atlantic salmon fast skeletal muscle is composed of an α-type tropomyosin that shares 20 substitutions with a mammalian homologue. Prominent isomorphisms considered to be potentially destabilizing include threonine 179 (core, Ala in rabbit) and a unique pair of glycines, residues 24 and 27. Bacterially expressed mutant tropomyosins were isolated without exposure to elevated temperature or organic solvent. The Thr179Ala mutant is more resistant to heat-induced denaturation (Tm > 40 °C) than the nonmutant control (Tm = 37 °C) as monitored by far-UV circular dichroism [0.1 M salt and 1 mM DTT (pH 7)]. Changing one glycine to alanine has no detectable effect on the Tm versus the control value. An increase of 1 °C is observed for the double mutant (Gly27Ala/Gly24Ala). The preferred site of chymotryptic cleavage of recombinant salmon tropomyosin is between Leu 11 and Lys 12. The rate of the subsequent cleavage at Leu 169, the preferred site in rabbit tropomyosin, is reduced via replacement of Thr 179 with Ala. Thin filaments reconstituted with this mutant display greater Ca(II) induction of the myosin steady-state MgATPase versus control. Glycine-induced local instability is demonstrated by Escherichia coli outer membrane protease T (Omp-T) cleavage between Lys 6 and Lys 7. The control is more susceptible to proteolysis at this site than the mutants, which are distinct from each other: control > Gly27Ala > Gly24Ala > double mutant (most resistant to Omp-T). Similarly, the double mutant is comparatively more resistant to cleavage at Leu 11. By inference, the mid- and amino-terminal sections of salmon tropomyosin are intrinsically less stable than those in mammals, suggesting greater flexibility. Neighboring glycines make up a new destabilization motif in tropomyosin.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,218
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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