MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2018360488 · doi:10.1161/circresaha.110.238709

A Novel Hypoxia-Inducible Spliced Variant of Mitochondrial Death Gene Bnip3 Promotes Survival of Ventricular Myocytes

2011· article· en· W2018360488 sur OpenAlexafffund
Hongying Gang, Hai Yan, Rimpy Dhingra, Joseph W. Gordon, Natalia Yurkova, Yaron Aviv, Hongzhao Li, Floribeth Aguilar, Aaron J. Marshall, Etienne Leygue, Lorrie A. Kirshenbaum

Notice bibliographique

RevueCirculation Research · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMitochondrial Function and Pathology
Établissements canadiensSt. Boniface Hospital
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésProgrammed cell deathCell biologyBiologyMyocyteRNA splicingMitochondrionAlternative splicingRNA interferenceApoptosisMessenger RNAMolecular biologyGeneRNAGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

RATIONALE: Alternative splicing provides a versatile mechanism by which cells generate proteins with different or even antagonistic properties. Previously, we established hypoxia-inducible death factor Bnip3 as a critical component of the intrinsic death pathway. OBJECTIVE: To investigate alternative splicing of Bnip3 pre-mRNA in postnatal ventricular myocytes during hypoxia. METHODS AND RESULTS: We identify a novel previously unrecognized spliced variant of Bnip3 (Bnip3Δex3) generated by alternative splicing of exon3 exclusively in cardiac myocytes subjected to hypoxia. Sequencing of Bnip3Δex3 revealed a frame shift mutation that terminated transcription up-stream of exon5 and exon6 ablating translation of the BH3-like domain and critical carboxyl-terminal transmembrane domain crucial for mitochondrial localization and cell death. Notably, although the 26-kDa Bnip3 protein (Bnip3FL) encoded by full-length mRNA was localized to mitochondria and provoked cell death, the 8.2-kDa Bnip3Δex3 protein encoded by the truncated spliced mRNA was defective for mitochondrial targeting but interacted with Bnip3FL resulting in less association of Bnip3FL with mitochondria and diminished apoptotic and necrotic cell death. Forced expression of Bnip3FL in cardiac myocytes or Bnip3(-/-) mouse embryonic fibroblasts triggered widespread cell death that was inhibited by coexpression of Bnip3Δex3. Conversely, RNA interference targeted against sequences encompassing the unique exon2-exon4 junction of the Bnip3Δex3 sensitized cardiac myocytes to mitochondrial perturbations and cell death induced by Bnip3FL. CONCLUSIONS: Given the otherwise lethal consequences of deregulated Bnip3FL expression in postmitotic cells, our findings reveal a novel intrinsic defense mechanism that opposes the mitochondrial defects and cell death of ventricular myocytes that is obligatorily linked and mutually dependent on alternative splicing of Bnip3FL during hypoxia or ischemic stress.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,033
Score d'incertitude au seuil0,501

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,130
Tête enseignante GPT0,330
Écart entre enseignants0,200 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations52
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCirculation ResearchMême sujetMitochondrial Function and PathologyTravaux en français237 207